Juan Pablo Nogués Peña, gerente de proyectos de Atome en Paraguay y primo del presidente Santi Peña, se encuentra en el centro de un potencial conflicto de intereses relacionado con la empresa británica que busca establecer una planta de fertilizantes verdes en Villeta. Atome ha amenazado con demandar al Estado paraguayo ante el CIADI si no se aprueban cambios en su contrato con la ANDE.
El 12 de noviembre de 2025, Atome solicitó a la ANDE una modificación de su contrato, proponiendo una tarifa de US$ 30/MWh. Apenas 15 días después, el 27 de noviembre, se firmó el Decreto 4999/2025, que reinstaló a Nogués como representante del Ministerio de Industria y Comercio (MIC) ante el Conacyt hasta 2027. El 16 de enero de 2026, se firmaron dos nuevos decretos que establecían tarifas de entre US$ 30 y 32 para el hidrógeno, cifras que coincidían con la solicitud de Atome.
Nogués ha negado cualquier influencia en estas decisiones, argumentando que su parentesco con el presidente no ha tenido un efecto en su trabajo. Sin embargo, su doble rol como gerente de Atome y consejero del MIC genera preocupaciones sobre la transparencia y la ética en la gestión pública.
En un intercambio con ABC, Nogués confirmó su relación familiar con el presidente, pero insistió en que este vínculo es irrelevante para las decisiones tomadas. Además, aseguró que no ha discutido los asuntos de Atome con su primo y que la empresa firmó su contrato con la ANDE durante la administración de Mario Abdo Benítez.
A pesar de sus declaraciones, la situación plantea dudas, especialmente porque el mismo Nogués fue nombrado por el presidente en 2023 para su rol en el Conacyt. Según datos revisados, no se ha encontrado constancia de su renuncia a este cargo, a pesar de su afirmación de haberlo hecho en mayo. La web del Conacyt aún lo lista como titular, lo que refuerza las interrogantes sobre la validez de su salida.
Desde el 9 de junio de 2026, el gobierno derogó los decretos que establecían las tarifas, tras recibir presiones del sector eléctrico, pero el contrato de 2022 permanece vigente. Atome ha advertido que si la ANDE no acepta la tarifa solicitada, el proyecto de US$ 665 millones podría verse comprometido.
La situación se complica aún más, ya que Atome ha emitido un aviso de controversia, reclamando que el gobierno de Paraguay incumplió con el tratado bilateral de inversión entre Paraguay y el Reino Unido. El abogado de la empresa ha indicado que no es necesario un contrato escrito para presentar un reclamo ante el CIADI, ya que las conversaciones previas podrían ser suficientes.
La falta de claridad sobre el rol de Nogués y su parentesco con el presidente exige respuestas de las autoridades pertinentes, tanto del MIC como de la Presidencia de la República, para asegurar la integridad del proceso y la confianza en la gestión pública.